Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms