Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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