Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms