Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms