Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LAMC2Q13753 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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