Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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FOXI1Q12951 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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FOXI1Q12951 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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FOXI1Q12951 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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FOXI1Q12951 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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FOXI1Q12951 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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FOXI1Q12951 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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FOXI1Q12951 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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FOXI1Q12951 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FOXI1Q12951 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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