Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms