Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms