Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNA1Q09470 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms