Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms