Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms