Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms