Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms