Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms