Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODC1P11926 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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