Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLGNO14967 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms