Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP17L12C9JPN9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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USP17L12C9JPN9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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USP17L12C9JPN9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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USP17L12C9JPN9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP17L12C9JPN9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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