Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRT4C9JH25 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRT4C9JH25 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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