Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms