Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCL27Q9Y4X3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCL27Q9Y4X3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCL27Q9Y4X3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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