Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTSFQ9UBX1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTSFQ9UBX1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTSFQ9UBX1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTSFQ9UBX1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTSFQ9UBX1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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