Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms