Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLF1Q9BQI6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms