Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC155Q8N6L0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC155Q8N6L0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms