Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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