Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms