Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC27A3Q5K4L6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms