Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms