Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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