Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NWD1Q149M9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NWD1Q149M9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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