Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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