Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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