Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
EIF4EBP1Q13541 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms