Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM2Q13029 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms