Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TTC32-202ENST00000402414 735 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC087072.2-201ENST00000621060 682 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ZNF839P1-201ENST00000403487 861 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC091820.1-201ENST00000523497 648 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB1Q02641 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms