Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APBA1Q02410 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms