Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms