Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL8P80075 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL8P80075 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL8P80075 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL8P80075 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL8P80075 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL8P80075 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL8P80075 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL8P80075 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms