Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms