Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP4P57723 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms