Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDF5P43026 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GDF5P43026 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDF5P43026 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms