Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA1P42261 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms