Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms