Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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