Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms