Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms