Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGFP01133 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EGFP01133 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EGFP01133 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EGFP01133 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGFP01133 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGFP01133 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms