Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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