Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTSS1O43312 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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MTSS1O43312 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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MTSS1O43312 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MTSS1O43312 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MTSS1O43312 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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