Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms